Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms