Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rps6ka4Q9Z2B9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rps6ka4Q9Z2B9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rps6ka4Q9Z2B9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rps6ka4Q9Z2B9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rps6ka4Q9Z2B9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Rps6ka4Q9Z2B9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rps6ka4Q9Z2B9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms