Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip6Q9Z1Y4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms