Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms