Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms