Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rspo1Q9Z132 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rspo1Q9Z132 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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