Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms