Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Nme3Q9WV85 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme3Q9WV85 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Nme3Q9WV85 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Nme3Q9WV85 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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