Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbck1Q9WUB0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms