Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms