Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms