Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clec4eQ9R0Q8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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