Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms