Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms