Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms