Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NumbQ9QZS3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NumbQ9QZS3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms