Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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