Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms