Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms