Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms