Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms