Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms