Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms