Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms