Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms