Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms