Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms