Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Tmod4Q9JLH8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Tmod4Q9JLH8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Tmod4Q9JLH8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms