Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms