Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms