Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Habp4Q9JKS5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Habp4Q9JKS5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms