Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms