Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms