Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpa33Q9JKA5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms