Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3glb1Q9JK48 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sh3glb1Q9JK48 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sh3glb1Q9JK48 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sh3glb1Q9JK48 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sh3glb1Q9JK48 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3glb1Q9JK48 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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