Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms