Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms