Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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