Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms