Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms