Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms