Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms