Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms