Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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