Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp29Q9ES63 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Usp29Q9ES63 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp29Q9ES63 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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