Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb3Q9ERD7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms