Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dap3Q9ER88 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms