Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms