Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ropn1lQ9EQ00 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms