Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs3Q9DCT2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs3Q9DCT2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs3Q9DCT2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms